تشخیص مولکولی سرووار بیماری زای سالمونلا انتریتیدیس به روش lamp با استفاده از مارکر اختصاصی غربال شده به وسیله روش های ژنومیک مقایسه ای
نویسندگان
چکیده
زمینه و اهداف: سالمونلا انتریتیدیس یکی از شایع ترین علل گاستروانتریت می باشد که در موارد حاد می تواند منجر به سپتی سمی و یا حتی مرگ شود. در مطالعه حاضر با استفاده از روش های ژنومیک مقایسه ای مارکرهای ژنی این سرووار غربال گردید و اختصاصی ترین مارکر با استفاده از روش lamp برای شناسایی این پاتوژن مورد هدف قرار گرفت. مواد و روش کار: این مطالعه در سال 1394 صورت گرفت. بمنظور یافتن مارکرهای ژنی سالمونلا انتریتیدیس ، 50 ژنوم کامل از سویه های سالمونلا انتریتیدیس و سایر جنس های خانواده انتروباکتریاسه با استفاده از روش های ژنومیک مقایسه ای موردبررسی قرار گرفتند. مارکر اختصاصی غربال شده با طراحی 6 پرایمر اختصاصی و با استفاده از روش lamp به منظور شناسایی سویه های سالمونلا انتریتیدیس هدف قرار گرفت (سویه های باکتریایی مورد استفاده در این مطالعه از بیمارستان های جنوب شرق کشور جمع آوری گردید). کارایی روش lamp برای شناسایی سالمونلا انتریتیدیس در نمونه های گوشت مرغ که بصورت مصنوعی به این باکتری آلوده شده بودند، نیز مورد ارزیابی قرار گرفت. یافته ها: ژن lygc به عنوان اختصاصی ترین مارکر برای شناسایی سویه های سالمونلا انتریتیدیس انتخاب شد. نتایج حاصل از روش lamp اختصاصیت این مارکر را برای شناسایی ایزوله های سالمونلا انتریتیدیس نشان داد. حساسیت این روش برای کشت خالص باکتری cfu/reaction 10 و برای نمونه های گوشت مرغ آلوده cfu/ml 103 در آغاز انکوباسیون و cfu/ml 10 بعد از 4 ساعت انکوباسیون ارزیابی گردید. نتیجه گیری: پژوهش حاضر اثبات می کند که روش ژنومیک مقایسه ای روشی کارآمد برای شناسایی مارکرهای ژنی اختصاصی می باشد. همچنین روش lamp حاضر می تواند یک ابزار قدرتمند، دقیق و ارزان جهت شناسایی سالمونلا انتریتیدیس در آزمایشگاه های کنترل کیفی مواد غذایی و تشخیص طبی باشد.
منابع مشابه
تشخیص مولکولی سرووار بیماری‌زای سالمونلا انتریتیدیس به روش LAMP با استفاده از مارکر اختصاصی غربال‌شده به‌وسیله روش‌های ژنومیک مقایسه‌ای
زمینه و اهداف: سالمونلا انتریتیدیس یکی از شایع‌ترین علل گاستروانتریت می‌باشد که در موارد حاد می‌تواند منجر به سپتی‌سمی و یا حتی مرگ شود. در مطالعه حاضر با استفاده از روش‌های ژنومیک مقایسه‌ای مارکرهای ژنی این سرووار غربال گردید و اختصاصی‌ترین مارکر با استفاده از روش LAMP برای شناسایی این پاتوژن مورد هدف قرار گرفت. مواد و روش کار: این مطالعه در سال 1394 صورت گرفت. بمنظور یافتن مارکرهای ژنی سالمون...
متن کاملشناسایی سریع و اختصاصی سرووار بیماری‌زای سالمونلا تیفی‌موریوم با استفاده از روش تکثیر هم‌دمای به‌واسطه حلقه (LAMP)
مقدمه: باکتری سالمونلا تیفی‌موریوم یکی از بیماری‌زاهای غذایی مهم و از علل شایع سالمونلوزیس است که گاهی به عفونت خون یا حتی مرگ منجر می‌شود. در مطالعه حاضر، این سرووار بیماری‌زا با روش تکثیر هم‌دمای به‌واسطه حلقه (LAMP) شناسایی شد. مواد و روشها: از 6 پرایمر اختصاصی برای تکثیر ژن STM4497 و شناسایی سویه‌های سالمونلا تیفی‌موریوم و از روش‌های کدورت‌سنجی و ژل-الکتروفورز برای آشکارسازی محصول‌های وا...
متن کاملمقایسهی دو روش مولکولی PCR و LAMP در تشخیص سالمونلا
Background and Objective: There are several techniques for the diagnosing of salmonella infectious. Several molecular methods such as PCR and hybridization assay have recently been used for the detection of this bacterium. However, these methods require precision instruments for amplification and complex procedures, which are the major obstacles to the widespread use of these methods in relativ...
متن کاملارزیابی ارتباط ژنتیکی سالمونلا انتریکا سرووار انتریتیدیس جدا شده از نمونه های انسانی و دامی به روش ERIC- PCR
Background & Aims: Salmonellosis is one of the vital infectious zoonotic diseases in both human and animals that is related with poultry, meat, egg and milk consumption. The aim of this study was evaluation of genetic diversity of Salmonellaenterica serovar enteritidis isolated from human and animals samples by ERIC-PCR method. Materials & Methods: In this cross-sectional study, 60 ...
متن کاملمقایسه دو روش LAMP فلورسنت و PCR در تشخیص مولکولی سالمونلا
Background and purpose: Salmonella is a group of Enterobacterias that cause infectious diseases in human and animals. Typhoid, bacteremia, enterocolitis and salmonellosis which are caused by this bacterium are considered major health concerns in developing countries, such as Iran. Quick, accurate, reliable and early diagnosis is vital to prevent Salmonella outbreak. Materials and methods: Ther...
متن کاملتایپینگ مولکولی جدایه‌های سالمونلا انتریکا سرووار اینفنتیس با استفاده از روش ERIC-PCR
زمینه: سالمونلاها از باکتری‌های مهم خانواده انتروباکتریاسه بوده که از نظر بیوشیمیایی و سرولوژیک بسیار متنوع می‌باشند و عمدتاً از راه مواد غذایی منتقل می‌شوند. گسترش سالمونلاهای غیر تیفوئیدی یکی از مهم‌ترین موضوعات قابل بررسی در تحقیقات امروزی می‌باشد. بنابراین تشخیص و تایپینگ سریع این بیماری‌زاها اطلاعات مناسبی در ردیابی و کنترل عفونت در اختیار می‌دهد. هدف از مطالعه حاضر تایپینگ سویه‌های بالینی ...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله میکروب شناسی پزشکی ایرانجلد ۱۱، شماره ۱، صفحات ۱۸-۲۹
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023